人在睡眠时和清醒时，体内各器官变化不同。睡觉时内脏发生的变化与睡眠的过程息息相关。特别是雷姆睡眠，表面上看，似乎睡得很熟，会发现只是眼球或手脚尖偶尔瞬间颤动一下，然后又一动不动了。而事实上，在雷姆睡眠阶段，人体内脏却处于相对活跃期，身体各器官起着相应的变化。
其中典型的例子是心脏的跳动。心脏在交感神经和副交感神经的相互作用下，调节着自身的节奏。人在努力工作时心脏节奏快，而在休息时相对安静。夜间和早上的脉搏数和血压值也就不同。在人们入眠后的初期阶段，身体开始发汗降温。随着睡眠向深层无雷姆睡眠阶段发展，体温进一步下降，开始出现深层睡眠。相反，在雷姆睡眠阶段，发汗作用基本停止，体温也不大变化。
不正常的发汗称为“盗汗”，因夜间盗汗过多而无法安睡的现象医学上称为“睡眠多汗症”，当然也有因体内水分过多或环境闷热等单纯物理性原因而造成的多汗现象。许多人在夏天睡觉时喜欢伸展四肢呈大字形以发散更多的热量，冬天时则蜷缩起身体尽量减少体温散发。身体无法调节好体温的人，常常会越睡越冷。
人的身体就是这样在睡眠中随着体温的调节慢慢进入深层睡眠，随着无雷姆睡眠的加深，脉搏和血压下降，如果在这时将人突然叫醒，因脉搏和血压急剧上升，会给心脏带来剧烈的负担。不能持续无雷姆睡眠时睡时醒的人，他的脉搏和血压也无法正常下调，从而引起高血压症。高血压不仅影响睡眠，还容易引起其他病症，形成恶性循环。从无雷姆睡眠到雷姆睡眠的交替过程中，脉搏会突然增加，变得没有规律，呼吸也变得时急时缓。呼吸道松懈时呼吸缓慢，呼吸道紧张时则呼吸急促。
这些雷姆睡眠时的变化结果，易引起心脏供血系统病变，严重时可能因心脏病突发导致死亡。有心脏病的人在雷姆睡眠时要特别注意。
再来看看肠胃的活动。
胃溃疡在睡觉时病情会加剧。甚至有人这样说：“睡觉时才有胃溃疡”，可见睡眠对胃溃疡的影响。特别是在雷姆睡眠时肠胃变化较大。胃太饱时睡眠会受到干扰，因为睡眠时消化器官仍然在进行一定程度的消化活动，但没有清醒时活跃，胃酸分泌也较少。
北京研究人员最近发现，睡眠不好可能会造成胃溃疡，甚至癌症。他们对两组老鼠进行了实验，其中一组老鼠在连续一星期的鼓声中度日，科研人员不断地击鼓，使它们每天只能有一小时的睡眠，结果研究人员在这组老鼠的胃壁上发现了肿瘤基因。
日本一项研究表明，不良的睡眠习惯可能导致感冒、糖尿病、肥胖、中风、心脏病和癌症。此外，经常缺乏睡眠还会造成精神疾病。
现在，“极昼社会”、夜班、电视、网络甚至旅游，使人们睡得越来越少。许多成年人还因疾病，如睡眠时呼吸暂停，造成睡眠质量低，进而导致睡眠不足。无论睡眠不足的原因是什么，但结果都是一样：白天昏昏沉沉，思路不清晰，不能明确表达自己的意思，无法集中注意力，动作不协调……儿童变得易怒，学习效率下降。以前人们认为这种影响只是暂时的，好好睡上一觉后就会恢复正常。但是，越来越多的研究结果表明，睡眠不足的影响会日积月累，最终严重危害健康。
专家指出，睡眠时有呼吸暂停现象的人患中风的可能性是正常人的3倍，患心脏病的可能也比正常人高得多。如果两个晚上不睡觉，血压会升高。如果每天只有4个小时的睡眠，胰岛素的分泌量会减少。仅一个星期，就足可以令健康的年轻人出现前驱糖尿病的症状。而且，缺乏睡眠使人难以抵抗传染病。免疫系统功能的减弱还会使抵御早期癌症的能力降低。