从高校开始扩招以来，其成就还是应该肯定的，高校大规模扩招使我国的高等教育由精英化转入了大众化发展阶段，我国的人力资源、人才资源发生了质变。
但是高等院校的大规模扩招所带来的社会问题却不容忽视。
来自教育部的一组数据称：1998年我国高等学校招生人数为108万人，随着1999年全国大规模高校扩招，2006年这一数字变成504万人，2007年达560万人。与此同时，2005年我国高校毕业生340万人，2006年增至413万人，2007年达到500万人左右。中国社会科学院2008年1月3日举行的2008年《社会蓝皮书》发布暨中国社会形势报告会传出消息，2007年全国近500万高校毕业生中，至今仍然有100万高校毕业生没有找到工作。社科专家指出，这种就业难的情况，发生在高等教育毛入学率只有20%的背景下，这一毛入学率其实远远低于周边的一些新兴的工业国家和地区。这种情况应该引起我们高度重视。
我国高等教育的扩招太盲目激进。提高高等教育的毛入学率、发展高等教育规模，是社会发展的必然要求，但是，以怎样的速度扩大规模，扩大何种层次高等教育的规模，由哪些学校来完成扩大规模的任务，这些问题必须经过充分的论证，才能付诸实践。但遗憾的是，我国高等教育规模扩大，并没有经过充分论证，而是快速上马。
在发达国家，高等教育大众化的任务，主要交给职业学校、社区学校完成，高等教育规模扩大，主要集中在职业教育层次，但是，我国高等教育扩招，主要由原来的精英教育学校承担，而且大力扩大本科教育层次和研究生教育层次，这种做法，不但使教育质量严重下降，而且也使人才培养结构严重失衡、高等教育自身也出现严重的定位错乱。虽然我国目前每年毕业的大学生达到500万，但是其中不少大学毕业生，具有的只是大学生的身份，而非大学生的质量。
曾有这样一个故事：重庆大学举办的一次校园招聘会上规定，本校学生可免费参加，外校学生参加需要购买门票。由于是限量销售，10元一张的招聘会门票在网上居然被炒到200元。
从农村考入北京师范大学中文系的四年级学生小贾平时生活俭朴，但为了制作求职简历，他已经花了四五百元。“我们班同学最少的投了二三十份简历，像我这样准备了上百份简历的大有人在。”小贾告诉记者，“竞争太激烈了，很多毕业生都采取‘广种薄收’的策略——外企、国企、公务员一个都不能少，所谓的‘双向选择’实际上已经变成了用人单位的‘单向选择’。”就在求职无门的时候，一部分毕业生便把目光投向了考研的队伍。于是，研究生教育也开始扩招。“很多学生考研的目的就是为了逃避就业压力，这是我国高等教育的悲哀。”中国传媒大学一位负责学生工作的老师如是说。
招生人数的激增，使得我国高等院校原有的办学规模很难应对，为了消化急剧膨胀的生源，高校开始了近乎疯狂的扩张，地方上也在轰轰烈烈地造城。目前我国在建和已建的大学城超过50座，多数都是依靠银行贷款建设，许多高校成为银行“债务人”。
随着高等教育扩招和大众化进程的加快，高校办学条件日趋紧张，不得不向外扩建。以沈阳为例，2001年沈阳师范大学异地置换并取得良好办学效益后，许多高校采用资产置换的办法，由城区向郊区搬迁，以获取新的发展空间和资金。目前，沈阳已形成南北两座大学城，占地面积近万亩，在校生近10万人。郑州大学2002年在距市区15公里处建设了新校区，该校在市区内还有三个老校区，为了接送住在老校区的教职员工上下班，每天至少要发40次班车，仅此一项每年增加开支上百万元；位于济南市长清区大学科技园内的高校，冬季取暖燃油一天要花费一两万元，面积大的学校甚至要五六万元。
民盟山东省委的一份调研报告显示，山东目前28所省属高校的银行贷款总和已经超过100亿元，个别高校负债高达十几亿元。
从1999年扩招开始卷入贷款风潮中的中国高等院校，2008年前后将陆续迎来还款高峰，进入还款期的高校将可能形成到期不能还本付息的局面。
33所普通高校，负债49亿元，每年利息支付近4亿元。“巨额债务已成为制约我省高校健康发展的重要因素，个别学校甚至资不抵债，‘破产’隐患凸显。”在2007年召开的政协甘肃省九届五次会议上，省政协委员、西北师范大学党委书记刘基呼吁政府应加大财政投入，以解决高校发展瓶颈问题。
据审计署审计数字：至2003年末，教育部等中央部门直属的清华、北大等18所高校负债72亿元，其中基本建设形成的债务占82%。背负巨额债务的不仅仅是中央直属的“名校”，各地一些省属高校，同样存在因贷款搞基建，债务包袱越背越沉的现象。
高校债务缠身，使居高不下的大学学费下降的可能性几乎为零。目前，有的大学已亏损运行，连债务利息都无法偿还，其实已经游走在“财务破产”的边缘。目前全国高校的债务已经超过2000亿元。
扩招确实需要高校加大对院校软件和硬件的投入，但也助长了高校“贪大求全”的浮躁风气。一些高校忽视了“特色办学”和“优势专业”，不顾校情，也不顾社会需要把目标锁定在“打造一流学校”上。这种盲目性往往造成高校专业设置、教学定位和培养目标的结构性不平衡。
以湖北省为例，2005年湖北省大学师生比为1：17，而扩招前的1998年，这一比例仅为1：11。教师数量的增长速度远远跟不上学生的增长速度。
“这就导致教师的教学量过大，教学手段难以到位，教学目的得不到保障。很多学校采取大堂上课的方式，无法照顾专业特点，一般专业的教学效果也可想而知。图书和实验设备严重不足，有的新校区没有图书馆，有实验室而缺实验设备，缺乏实习场地和必要的实习条件。高校办学条件的改善滞后于学生规模的扩大，影响着高校教育质量。”全国人大代表王志民说。